Les relations entre Le Caire et Doha se sont détériorées suite au coup d’Etat fomenté par l'armée égyptienne qui a destitué, en juillet 2013, l'ancien président démocratiquement élu. Les autorités égyptiennes, actuellement au pouvoir, sont par ailleurs régulièrement accusées par les défenseurs des droits de l'homme d'avoir instauré un régime ultra-autoritaire.

En juin dernier, les liens entre les deux pays se sont encore détériorés après la condamnation de Mohamed Morsi à une double peine, l’une à perpétuité et l’autre à quinze ans de prison pour "intelligence avec le Qatar". L’ancien chef d'Etat ainsi que dix autres co-prévenus, étaient accusés par un tribunal d’avoir procédé à "des actes d'espionnage" et d’avoir "transmis des documents confidentiels pour le compte du Qatar". Ces accusations portaient sur la durée du mandat présidentiel qui s'était écoulée de juin 2012 à juillet 2013. En outre, deux journalistes d’Al Jazeera ont été condamnés à mort par contumace, sentence sans précédent, et vigoureusement dénoncée par les associations de défense des droits des journalistes.